こっそりと学園を抜けだした睦明。
謎の女に導かれ、伝説の剣があるという無人島を目指す。
上陸した二人は、そこで謎の施設を発見する。
無人のはずの島で、密かに企てられていた世界転覆の陰謀に、睦明が諸葛千術で立ち向かう。
傷を追いながらも前に進む睦明であったが、そこには秘密結社の罠が…